阿里巴巴9月30日阿里巴巴集團發佈年度股東大會公告，馬雲自9月30日起，不再擔任阿里巴巴集團董事。不過，他仍為阿里巴巴合夥人之一。
卸任後仍有控制權 主要投入公益
聯合新聞網報道，馬雲早就計劃辭去阿里巴巴董事會要職。2018年9月10日，馬雲發表公開信表示，一年後的阿里巴巴20周年之際，即2019年9月10日，由張勇接替，他不再擔任集團董事局主席。
聯合新聞網並說，張勇接任阿里巴巴董事局主席後，阿里巴巴於2019年11月26日重回港股，當天港股收盤，阿里巴巴市值達港幣4.01兆元。截至9月30日港股收盤，阿里巴巴市值為港幣5.91兆元，這意味不到一年時間，阿里巴巴市值增加港幣1.9兆元。
YAHOO新聞認為，這並不代表馬雲卸任後，就喪失了對阿里巴巴的控制權，馬雲在公開信中表態，即使他卸任董事局主席，他也不會完全退休，這是他「認真準備了10年的計劃」。身為阿里巴巴永久合夥人的馬雲和蔡崇信，就算離開了董事會，依舊對阿里巴巴擁有足夠的控制權。
陸媒新浪財經報道，馬雲也如他所承諾的一樣，永遠是阿里的首位員工及合夥人。2020年，以馬雲公益基金會為首，阿里巴巴投入全球抗疫和援助小商店恢復產能。馬雲自身也依照多年的願望，將更多力量投入公益與教育，包含推動偏鄉教育、環境保護及創業家發展等事業。
YAHOO新聞報道，目前阿里巴巴的董事會成員，包括董事張勇、武衛、蔡崇信、J. Michael Evans、井賢棟、Kabir Misra，以及獨立董事、郭德明、董建華、楊致遠、E.Börje Ekholm、Wan Ling Martello。
港交所的公告顯示，阿里巴巴於9月30日舉行的年度股東大會上，武衛、Kabir Misra及郭德明各自擔任公司第三組董事，均將任職三年或任職至其繼任人獲推選或委任並獲得相符資格為止。
中共體制下 馬雲或為被迫退休
中共十八大後的劇烈反腐敗運動中，大量民營企業家受到牽連。對此，2013年馬雲在一次演講中說道，絕不與政府做生意：「在過去的14年中，阿里巴巴始終堅持的信念是『只和政府談戀愛，但不結婚』。」
4年之後，《2017企業家刑事風險分析報告》顯示，2017年被定罪的中國企業家中，民營企業家就佔了將近九成（86.6%）。
在中共體制下，恐怕不和政府做生意也無法逃過一劫。BBC報道馬雲曾說，「如果國家需要，我隨時可以將支付寶無償獻給國家。」香港中文大學經濟學系副教授莊太量分析，阿里巴巴的背後是中國互聯網公司需要面對的複雜政治難題。
2016年第20屆聖彼得堡國際經濟論壇上，主持人問馬雲：「甚麼是你人生最大的錯誤？」馬雲回答：「想聽實話嗎？我人生中最大的錯誤是創立了阿里巴巴！」
馬雲當時回應，他並非「心血來潮，更不是迫於壓力」才辭去阿里巴巴董事長職務。然而，外界質疑在近些年來私企老闆頻頻出事之際，馬雲卸任的內幕可能並不單純。
也許馬雲2013年在接受採訪時便已經預知自己的結局，他曾直言：「阿里從來不只屬於馬雲，但馬雲會永遠屬於阿里。」、「中國的企業家確實沒有好的下場，事實也是、歷史也是。」
2018年9月10日，馬雲公開宣佈：阿里巴巴20周年之際，將不再擔任集團董事局主席。
2018年10月，阿里巴巴證實，馬雲已無阿里經營實體（VIE）所有權。
2019年9月10日，馬雲55歲生日、阿里集團成立20周年之際，馬雲辭去阿里巴巴集團董事局主席職務，CEO由張勇接任。
2020年9月30日，馬雲卸下阿里巴巴集團董事一職。@
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