針對中共稱上海復星醫藥供應台灣1,333萬劑BioNTech（復必泰）疫苗，台灣中央流行疫情指揮中心予以駁斥，強調國台辦對台灣防疫發言內容錯誤。
台灣中央流行疫情指揮中心12月31日表示，指揮中心均秉持防疫優先之原則進行各項防疫工作，有關中共國台辦針對台灣防疫之錯誤發言內容，相關澄清說明如下：
一、鑒於兩岸往來頻繁，為掌握疫情狀況，向來致力與中國大陸保持資訊交流，「我方自2019年12月31日至2021年12月28日，與中國大陸透過正式管道就COVID-19疫情往來資訊包括陸方提供我方疫情資訊286次，我方提供陸方包括個案大陸旅遊史等資訊共50次。」
中共國台辦發言人馬曉光12月29日在例行記者會中說，陸方支持上海復星醫藥集團參與研發並獨家代理的BioNTech疫苗服務台灣民眾，並稱上海復星醫藥供應台灣BioNTech疫苗，本年度運抵台灣共計達1,333萬劑。
台灣中央流行疫情指揮中心表示，「我方洽詢陸方疫情訊息計85次，陸方回覆我方疫情資訊21次，而陸方洽詢我方疫情訊息29次，我方回覆陸方疫情資訊28次。陸方電話洽我方聯絡疫情資訊7次，我方電話洽陸方聯絡疫情資訊8次。」
此外，「陸方提供我方技術文件共計12次。相關數據都有文件紀錄可查數，國台辦提供數據有與事實不符之處」。
馬曉光說，陸方今年迄今向台灣通報疫情達324次、分享COVID-19防治技術資料16次，同意台灣衛生專家參加世界衛生組織（WHO）技術性會議20餘次。
二、為與國際分享、交換衛生、防疫經驗，台灣均積極爭取參與世界衛生組織相關會議，自2009年至2021年，共向WHO申請參加220場技術性會議，但僅77場獲邀出席。
三、為守護國人健康，台灣政府一直多方洽談COVID-19疫苗購買，在BioNTech疫苗取得上，為尊重BioNTech原廠疫苗商業代理權劃分，BioNTech疫苗係由台積電、鴻海／永齡基金會、慈濟基金會三捐贈方委託裕利醫藥公司，向原廠代理商復星實業公司（香港復星）有償購買。
指揮中心表示，在基於「原廠製造、原廠標籤、直送台灣」三原則的共識，全部無償捐贈政府統籌運用，對於捐贈單位出錢、出力，無私付出，不應被扭曲抹殺。指揮中心強調，疫情尚未止息，人民健康福祉為先。兩岸應互助合作，防疫優先，才能維護兩岸民眾健康。#
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