檢驗真菌DNA序列 準確找出菇類進食中毒源頭

醫院管理局昨日（16日）起一連兩天舉辦研討大會，瑪嘉烈醫院病理學部顧問醫生張耀君今日（17日）發表題為「通過DNA測序進行準確的真菌分類」（Accurate Fungal Classification by DNA Sequencing）的演講，介紹檢驗真菌DNA序列，準確找出中毒源頭的技術應用。

張耀君介紹，野外採摘菇菌引起的中毒包括誤食綠褶菇（大青褶傘、綠孢環柄菇）引致腸胃不適、誤食鵝膏菌引致肝衰竭。另外，坊間購買菇菌引起的中毒包括牛肝菌中混合不能食用的品種引起腸胃不適。過往3年，政府食安中心已5度呼籲市民停止食用或帶有毒性的真菌。

張耀君指出，以往菇菌中毒分析主要透過病人臨床表現、真菌學家辨認菇菌、生化分析（如尿液、血液）化驗毒素，準確率約七、八成。但診斷困難包括病人或無法溝通、沒有提出有食用過菇菌類；菇菌類已經煮熟或切細至難以辨認；以及罕見的菌類毒素本港可能未有方法分析。

2020年成為常設服務

張耀君表示，以PCR測出真菌的基因序列從而分辨不同真菌的技術於2012年面世。2018年，醫管局設於瑪嘉烈醫院的毒理學參考化驗室開始試驗，透過菇菌中毒個案收集得來的菇菌樣本或病人胃液內的殘餘物進行菇菌DNA排序分析，成功取得突破，將有關技術延伸至臨床層面應用。2020年起成為常設服務。

關於以DNA（脫氧核醣核酸）檢驗真菌的流程。首先，收集真菌樣本或殘餘物抽取DNA，再利用PCR及測序技術獲得基因序列；隨後利用比較基因組學的方法，把基因序列與國際常用的物種基因資料庫作出對比，從而找出相似的真菌品種。

他提到，本地真菌學家合作檢驗25個臨床中毒案例中的43個真菌標本，可將86%採集樣本確認為一個已知物種（Species），其餘14%確認為一個「屬（Genus）」。另外，在香港採集50種真菌，可以將88%採集樣本確認為一個已知物種（Species），其餘12%確認為一個「屬（Genus）」。在是次研究中，所有樣本均能準確辨認，在76%至80%案例可以在傳統方法之上提供更多資訊，從而減少其它不必要的檢查。