中國大陸濫用抗生素的問題很嚴峻，近期的研究發現，長江流域抗生素濃度偏高，水生態系統受到破壞。長三角約40%孕婦的尿液中檢出抗生素，近80%兒童的尿液中檢出獸用抗生素，部分檢出的抗生素已在臨床中禁用，有可能嚴重損害人體免疫力。
據《瞭望》新聞周刊報道，最近大陸部分高校與科研院所的調查顯示，長三角約40%孕婦的尿液中檢出抗生素，近80%兒童的尿液中檢出獸用抗生素。這意味著大陸的抗生素污染，尤其是長江水體污染現狀堪憂。
河海大學長江保護與綠色發展研究院近期一項調研顯示，長江抗生素平均濃度為156納克／升，高於歐美一些發達國家。長江下游抗生素排放量居全國前三位，年排放強度大約為60.0千克/平方公里。
南京水科院生態所所長、長江保護與綠色發展研究院生態環境中心主任陳求穩教授研究發現，抗生素及其代謝產物對不具耐藥性的微生物、浮游植物、魚類等水生生物有潛在毒理風險，破壞水生食物鏈的能量傳遞，進而影響高營養級生物及水生態系統健康。
南京水科院生態所高級工程師王智源認為，「如果抗生素使用不嚴加管控，未來仍存增長趨勢。」他指出，長三角地區人類活動強度高、抗生素使用量大，抗生素污染防控形勢相比長江中上游更嚴峻。
抗生素污染的源頭來自幾個方面，一是醫用，二是畜牧養殖業，三是食品加工業和公眾日常生活使用，但以前二者為主。
長江水中抗生素主要來自醫院和藥廠廢水、水產和畜禽養殖廢水以及垃圾填埋場。
報道稱，調研顯示，長江下游抗生素排放量居全國前三位。長三角某市水源地附近有3家醫藥公司排污口，一些長江支流交匯處有六、七家製藥廠，廢水含有高濃度抗生素。
大部分的抗生素無法在現有工藝下有效去除，導致河湖水體成為抗生素和耐藥性的基因庫，將威脅長江流域民眾安全。
大陸多名專家指出，當前大陸對抗生素濫用監管不足，導致目前江河湖庫水體抗生素含量嚴重偏高。
中國是抗生素濫用最嚴重的國家。此前就有報告稱，中國人每年使用近8萬噸抗生素，動物使用的則更多；抗生素又通過各種方式進入水、土中，致使中國人飯桌上的雞、鴨、豬、牛、魚全部淪陷，循環後，再一次危及人體。
2015年時任中國科學院廣州地球化學研究所研究員應光國說，「中國是全球最大的抗生素生產國和使用國」。
2015年4月，中共喉舌央視新聞報道稱，當年復旦大學的研究報告顯示，江蘇、浙江、上海一千多名8到11歲在校兒童的尿液檢測中，有近六成的兒童尿液含有抗生素，四分之一檢出超過兩種抗生素，有些甚至有6種抗生素。
2015年6月，《羊城晚報》報道稱，2014年5月，華東理工大學等機構發表的研究報告中顯示，中國地表水中含有68種抗生素。世界衛生組織也曾多次警告中共，若不控制中國的抗生素濫用，將會害了全世界。
報道說，2015年中國科學院研究員應光國團隊給出的報告指出，中國珠江、長江、黃河、海河、遼河等58條主要河流均檢出抗生素殘留，北方的海河、南方的珠江流域抗生素濃度值最高，年平均超過79.3千克/平方米；總體而言，中國東部流域的抗生素排放量密度是西部的6倍以上。#
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